1. 有机肥生产线中不能忽视堆肥的发酵过程。有机肥的主发酵(即高温发酵)阶段一般需7-10天，经过这个阶段物料只是发酵分解了部分有机物，而一些复杂的大分子物质尚未分解完毕，远未达到营养化、稳定化的程度，必须再经过15-30天的二次发酵阶段，有机肥才能达到完全腐熟和稳定化的程度。一些有机肥生产商只经过7-10天的高温发酵阶段，就将肥料出厂销售了，所以有机肥生产中应注意发酵处理。

 2. 生产有机肥时，造粒烘干阶段的温度不能过高。如果有机肥进行造粒烘干时，入料口的温度高达200℃，致使有机肥里的胶体物质坚硬，杀死有机肥内的有益菌，会造成不可逆反应，严重影响有机肥的质量及使用效果。因此，生产有机肥时一定要控制好温度，肥料设备的入料口温度以100℃以下为宜，防止有机肥里的胶体物质因温度过高而失效。

3. 在有机肥生产线中加入氮磷钾化肥和其他营养成分，提高有机肥的养分。有机肥料养分全面，持续时间长，能改良土壤理化性状及微生物活性，优点很多，但有机肥的养分含量低，供肥强度小。所以在有机肥里加入化肥，生产有机无机复混肥，成品的质量好。